PCR實驗室(shì)建(jiàn)設所(suǒ)需資料
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1周前
4月26日,國家衛健委(wěi)舉辦全國視頻會議,明確提出“所有縣區級以上疾控機構、二級以上綜合醫院(yuàn)要抓緊進行改造,在短時(shí)間內形成核酸檢測能力”。
各地的公立(lì)機構檢測能力不(bú)能滿足需(xū)求隻是暫時的,獨立醫學實(shí)驗室在充實(shí)檢測力量(liàng)的同時,發揮自己豐富的檢驗管理運營(yíng)理念,以及區域化覆蓋的經驗優勢,融入到“國家隊”核酸(suān)檢測(cè)能力的建設(shè)中,順勢而為,乘勢而上。
隨著各地都在建立PCR實驗室,本文從硬件基礎的角度,梳理了PCR實驗室建(jiàn)設的幾個關鍵點,獨立醫(yī)學實驗室可以運(yùn)用豐富的運營經驗,進行建設指(zhǐ)導、人員梯隊建立、質控體係搭建、區域化服務支持(chí)等。
如何建設PCR實驗室
與PCR實(shí)驗室建設相關的指導文件主要有四份:
《醫療機構管理條例》
《醫療機(jī)構臨床實驗室管理辦法》
《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》
《醫療機構臨床基因擴增(zēng)實(shí)驗室管理辦法》
要求臨床PCR實驗室,不但(dàn)在(zài)實驗室設置及儀器設備等硬(yìng)件上要(yào)滿足(zú)開展臨床檢驗的(de)條件,而且要求實驗室(shì)在(zài)日常工作要有文件化的工作程序。
下麵就在(zài)PCR實(shí)驗室建設(shè)過程中的幾個關鍵控製(zhì)點進行闡述:
01
建(jiàn)立PCR實驗室質量管(guǎn)理(lǐ)體係
根據實驗室的具體情況編寫質(zhì)量體係文件,《質(zhì)量(liàng)手冊》、《程序文件》、《作業指導書》,並保證管理體係運行有效。
管理體係的特點是應有明確的目的、規範(fàn)的(de)管理、有效的製約、高效的機製、能自(zì)我發展的整(zhěng)體。
建立完善的SOP文件,對完成各項質量活動的方法作出規定,每個SOP都應對一個或一組相互關係的活動進行描(miáo)述。
每個SOP文件應說明該項質量各環(huán)節的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人(rén)員、記(jì)錄以及它(tā)們與(yǔ)有(yǒu)關活動的接口關係。
明(míng)確每個環節轉換過程中各項因素的要求,即由誰做、做什麽、做到什麽程序、達到什麽要求,如何控製、形成(chéng)什麽記錄和報告,以及相應(yīng)的審(shěn)批手續。
規定在質量活動中需要注(zhù)意的例(lì)外或特殊情(qíng)況的糾正措施。SOP應簡練、明確(què)和易懂並(bìng)且工作(zuò)人員熟練掌握和嚴格遵守。
02
PCR實(shí)驗室的相關設置
要完成一組PCR實驗(yàn),通常需要經過試劑配製、樣品處理、核酸擴增和產物分析4個實(shí)驗過程。
這4個實驗過程的實驗用房應相鄰布置(zhì),組(zǔ)成一個獨立的PCR實(shí)驗區。標準的PCR實驗區(qū)包括(kuò):試劑準備區、標(biāo)本製備區、擴增區、產物分析區、各區配套的緩衝區及公(gōng)共走廊。
PCR實驗室(shì)整體平麵布局
某醫院PCR實驗室平麵(miàn)布(bù)局如圖1所示,整個區域(yù)有一個公用走廊,每個獨立實驗區設有專門的緩(huǎn)衝區。通過(guò)壓差控製(zhì),使整個PCR實(shí)驗過程中試劑和標本免受(shòu)氣溶膠的汙染,並且(qiě)降低擴增產物對人(rén)員和環境的汙染。
圖表1、某醫院PCR實驗室平(píng)麵圖
試(shì)劑準備區(qū)
該實驗區主要進行的操作為(wéi)貯存試劑的製(zhì)備、試劑的分裝和主反應混合液的製備。
試(shì)劑(jì)和用於標(biāo)本製作的材料應直接運送至(zhì)該區,不得經過其他區域。試劑原材料(liào)必須貯存在本(běn)區內,並在本區內製備成所需(xū)的貯存試劑。
試劑準備區配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們(men)計算在內。
房間的麵積宜(yí)控製在15m2~20m2。本區的(de)壓力梯度要(yào)求為:相對(duì)正壓狀態,以防止外界(jiè)含(hán)核酸氣(qì)溶膠(jiāo)的空氣進入,造成汙染。
標本(běn)製備區
該區域主要進(jìn)行(háng)的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加(jiā)入至擴增反應(yīng)管(guǎn)和測定RNA時cDNA的合(hé)成。
標本製備區配(pèi)備有2~8°C冰箱和(hé)-20°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們計算在內。在標本製備區,還(hái)需要配備生物安全櫃,用於(yú)進行提取核酸的操作。
為(wéi)避免提取的核(hé)酸(suān)在櫃內反複循環,造成標本之間的交叉汙染,出現假陽性(xìng)結果,該區域配備的生物(wù)安全櫃必須是B2型的。生物安全櫃工作區垂直氣流全(quán)部來自實驗室,排風經過高效(xiào)過濾(lǜ)器(www.gdlingjie.net)過濾後直接排至室外,不允許回到安全櫃和(hé)實驗室(shì)中。
根據經驗,如果實(shí)驗(yàn)室內(nèi)配備生物安全櫃,每配備(bèi)一台,實(shí)驗室的麵積增加10m2;標本製備區(qū)的麵積宜在25m2~30m2之間(jiān)。本區的壓力梯度要求為:相對於鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近(jìn)區進入本區的氣溶膠汙染。
擴增室
該區域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已製備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本製備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯(zhù)存和製備(bèi)區)製備成(chéng)反應混合液等也可在本(běn)區內進行。
在巢式PCR測定中(zhōng),通常在第一輪擴增後必(bì)須打開反應管,因此巢式擴增有較高的汙染危險性,第二次加樣(yàng)必須(xū)在本區(qū)內進行。
擴(kuò)增(zēng)室主要配備PCR實驗(yàn)室的核心儀(yí)器PCR儀,本文實(shí)例中使用了ABI7500和ABI9700兩種PCR儀。
在實驗室建(jiàn)造過程中,需要給PCR儀配備專門的UPS電源,以保證其正常工作。該區麵積控製在15m2~20m2。
本區的壓力梯度要求為:相對於鄰(lín)近區域為負壓,以避(bì)免氣溶膠(jiāo)從本區漏出。為避免(miǎn)氣(qì)溶膠所致的汙染,應盡量減少在本區內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超淨台內進行(háng)。建議采(cǎi)用5~10Pa壓差,在控製上比較容易實現。
產物分析區(qū)
該(gāi)區域主要進行的操作(zuò)為擴增片段(duàn)的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測,此區域可(kě)不設。
在室內配備通風櫥,保證房間內的相對負壓,空氣從室外流向室內。該區麵(miàn)積控製在15m²~20m²。
本(běn)區是最主要的擴增產(chǎn)物(wù)汙染來源,因此對本區的壓力梯度的要求為:相對於鄰近區域為負壓,以(yǐ)避免擴(kuò)增產物從本區擴散至其它區域。建議采用5~10Pa壓(yā)差,在(zài)控(kòng)製上比較容易實現。
03
正負壓區域緩衝室(shì)的設置
根(gēn)據壓力梯(tī)度的要求,試劑配製室(shì)和樣品處理室為相對正壓(yā),擴增室(shì)和產物分析室為相對負壓,要求正壓的區域和(hé)要求負壓的區域的(de)緩(huǎn)衝室內的(de)壓(yā)力設計(jì)大不相同。
正壓緩衝室符合一般正壓潔淨室的緩衝原(yuán)則,主要是防止室外環境空氣中的氣溶膠進入室內。正壓緩衝室的布置如圖2所示(shì)。
圖表2、正(zhèng)壓緩衝室的布置圖
負壓(yā)緩衝室則是要求緩衝室對核酸擴增室及產物分析區(qū)保持正壓(yā),對緩衝室外也保持正壓(主要是滿足室內淨化需要(yào),如室內無潔淨要求,此處可(kě)以為0壓)。負壓緩衝室的布(bù)置如(rú)圖3所示。
圖表3、負壓緩衝室的(de)布置圖
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