垂直流超淨工作台和水平流（liú）超淨工作台有不同的效果。超淨工作台根據氣流的方向分為垂直流超淨工（gōng）作台和水平流超淨工作台，垂直流工作台風機在頂（dǐng）部，噪音較大，風垂直吹多用在醫藥工程（chéng），垂直流風（fēng）保證人的身體健康；水平流（liú）工作台噪音較小，風向往外（wài），多用在電（diàn）子（zǐ）行業。
1、水平層流超淨工作台：是一種通用性較強的局部潔淨工作台，它廣泛用於電子、國防、精密儀器、儀表、製藥行業等。
2、垂直層流（liú）超（chāo）淨工作台：垂直單向（xiàng）流超淨工作（zuò）台廣泛應用於需要局部潔淨的區域。實驗室、生物（wù）製藥、光電產業、微電子、硬盤製造等領域。
水平送風（fēng）與垂直送風工作台都能滿足（zú）實驗需要，所（suǒ）要考慮的就是氣（qì）流流型（根據實驗看哪種送風形（xíng）式對實驗影響最小）。
一般都是用垂直的；垂直送風的也就是垂直向下吹，垂直流形，準閉合式台麵，可有效防止（zhǐ）外部合流透入及操作異味對人（rén）體的刺激。如果在工作（zuò）台裏放顯微鏡,那垂直送風的氣流會被顯微鏡阻擋，這（zhè）種情況就要選擇水平風；但一般的實驗都用垂直的，玻璃（lí）門一般都是上（shàng）下移動（dòng）的。
總的來說，水平與垂直送風（fēng）不存在明顯的優劣（liè）之分，根據實驗要求選擇合適的類型。
超淨台使用壽命的長（zhǎng）短（duǎn）與空氣的潔淨度有 。在溫帶地區超（chāo）淨台可在一般實驗室使用，然而在熱帶或亞熱帶地區，由 大氣中含有 量的花粉，或多粉塵的地區，超淨台則宜放在較好的有雙道門（mén）的室內使（shǐ）用。
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